ソフトウェア

Motion-triggerd average

細胞エッジの速度パターンによる分子活性度のスクリーニング

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Kunida et al., Decoding cellular deformation from pseudo-simultaneously observed Rho GTPase activities, Cell Reports, 42, 2, 2023.

BQuant

微小管断面の画像のラインスキャンから、微小管の太さや本数を推定

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Wong JH, et al., Basic proline-rich protein-mediated microtubules are essential for lobe growth and flattened cell geometry, Plant Physiology, 2019.


Bayesian traction force estimation

牽引力顕微のビーズ変位に細胞形状の事前知識を適用して細胞が生む力を推定

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Fujikawa R, et al., Bayesian traction force estimation using cell boundary-dependent force priors, Biophyscal Journal, 2023.

Neuronal polarization

神経細胞が1本の神経突起だけを長く伸ばして極性化する過程をシミュレートする定量メカノモデル。

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Toriyama M, et al., A Diffusion-based neurite length sensing mechanism involved in neuronal symmetry-breaking, Mol. Syst. Biol., 6:394, 2010.